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微生物交叉感染
致病菌可以通过一种食品给另一种食品，感染的方式可以是食品的直接接触，也可能是通过食品操作人员、食品接触面或者空气间接感染。原料、未经加工的食品要与即食食品有效的隔离，隔离可根据食品的物理性质或按时间间隔来完成，并要对中间物进行有效地清洁，必要时还要对其进行消毒。
进入加工区域的人员需要严格管理或控制。尤其是进入风险较大的加工区，一定要有更衣设施。工作人员进入这些区域前需要洗手和穿戴干净的保护服装（包括鞋子）。
与食品有关的接触面，器具、设备、固定装置使用后必须彻底的进行清洗，必要时，在处理食品原料，尤其是肉类和家禽类之后还要进行消毒。

初级生产中的清洁、维护及个人卫生
使用适当的设备及程序以确保：
· 有效地进行任何必要的清洁及维护；
· 保持适当的个人清洁卫生。
工厂：设计和设施
目的：
根据食品生产性质及相关的风险，厂房、设备和设施位置的选择、设计和建造应能保证达到以下要求：
· 使污染减至程度；
· 设计和布局合理，便于维护、清洗和消毒，同时使空气带来的污染降低到；
· 表面及材料，尤其与食品直接接触的表面和材料，根据其用途，应是无毒的；必要时还应具有适当的耐用性并易于清洗和维护；
· 必要的环节，应配有对温度、湿度和其它控制所需的设备和设施；
· 可有效地防止昆虫的进入和藏匿。
理由：
良好的卫生设计和结构、合理的布局并提供充足的设施，对于进行有效的危害控制是必要的。

食品危害的控制
食品经营者应该通过运用诸如HACCP的体系来控制食品危害。他们应该：
· 识别食品加工操作过程中对食品安全起关键作用的所有步骤；
· 对关键步骤实施有效的控制程序；
· 监测控制程序，确保它们持续有效；
· 定期或操作进行变更时，对控制程序进行评审。
这些体系应该运用于整个食物链，通过适当的产品加工和设计来控制产品保质期内食品卫生。
控制程序可以很简单，例如：检查存货周期校准装置，或正确使用冷藏展示柜。有时候，听取*的建议和具有相关文件记录的体系可能更好。这种食品安全体系的模型在HACCP体系和应用指南（附录）中有描述。


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